30 июня 1953 года согласно директивы Начальника штаба СФ № 1/00591 от 5 июня 1953 года по штату № 94/2-Д, с подчинением начальнику медицинской службы флота для обеспечения личного состава Северного флота была сформирована 83 поликлиника СФ в г. Североморске.
1 октября 1994 года согласно директивы ГВМУ МО РФ № 161/1/1/5585 от 5 ноября 1993 г. она преобразована в 83 консультативно-диагностическую поликлинику.
26 сентября 2006 года 83 Консультативно-диагностическая поликлиника (83 КДП) на основании приказа Командующего Северным флотом от № 820 была переименована в федеральное государственное учреждение 83 консультативно – диагностическая поликлиника Северного флота (ФГУ «83 КДП СФ»), (приказ начальника поликлиники от 28.11.2006г. № 368).
16.11.2009 года в соответствии с директивой Главного военно-медицинского управления МО РФ от 06 августа 2009г. № 161/1/1/5187 в ФГУ «83 КДП СФ» были завершены мероприятия по переводу на новый штат 27/131.
Во исполнение директивных указаний Главного военно-медицинского управления МО РФ от 15 октября 2009г. № 161/1/1/7104 и организационно-мобилизационного управления Северного флота № 34/1/2286 от 21 октября 2009 г. были проведены организационно-штатные мероприятия по переходу на штат № 27/147 Военно-морского клинического госпиталя (Северного флота) с реорганизацией консультативно – диагностической поликлиники путем присоединения к ФГУ «1469 военно-морской клинический госпиталь Северного флота».
01.12.2009 г. после получения выписки из штатного расписания ФГУ «1469 ВМКГ СФ» Консультативно – диагностической поликлиникой были проведены мероприятия по укомплектованию штатного расписания сотрудниками из числа гражданского персонала.
Во исполнение распоряжения Правительства Российской Федерации от 29.03.2012 года № 422-р создано федеральное государственное казенное учреждение «1469 Военно-морской клинический госпиталь Министерства обороны Российской Федерации путем изменения типа федерального государственного учреждения «1469 военно-морской клинический госпиталь Северного флота».
В соответствии с директивой Министра обороны РФ от 27 мая 2013 года №№ Д-23 и Д-24, приказов Министра обороны РФ от 27 мая 2013 года №№ 396, 397, 398, указаний начальника ГШ ВС РФ от 26 июня 2013 года №314/6/3175 КДП в составе головного учреждения с 01 сентября 2013 года переведена на штат 27/417-51(01) и содержится численностью 243 должности гражданского персонала.
На сегодня консультативно-диагностическая поликлиника ФГКУ «1469 ВМКГ» Министерства обороны Российской Федерации является базовой поликлиникой в Североморской зоне ответственности и ведущим консультативно-диагностическим амбулаторно-поликлиническим учреждением Северного флота.
На медицинское обеспечение к поликлинике прикреплены свыше 20 тысяч военнослужащих, военных пенсионеров и членов их семей.