Формирование военно-морского госпиталя в г. Мурманске было обусловлено созданием в июне 1933 года Северной флотилии.
Мурманский военно-морской госпиталь сформирован 9 июля 1933 года на основе Директивы Управления ВМС РККА № 3537 – 1933 г. и был первым госпиталем северной флотилии. Госпиталь располагался в части здания железнодорожной поликлиники.
В 1935 году согласно приказу Командующего и Военного комиссара Северной флотилии № 002 от 03.02.1935 г. в г. Полярном было сформировано отделение Мурманского военно-морского госпиталя (лазарет на 50 коек), ставшее в 1936 году Полярнинским военно-морским госпиталем.
С декабря 1939 года госпиталь стал 200 коечным и был переведен в здание школы.
Во время советско-финской войны 1939 – 1940 гг. госпиталь принимал непосредственное участие в оказании квалифицированной помощи раневым и больным, которые эвакуировались в г. Мурманск с передовой.
Кроме лечебных функций, госпиталь проводил переподготовку поступивших на фронты врачей и среднего персонала.
С началом Великой Отечественной войны, госпиталь вошел в состав действующей армии и до июня 1942 года являлся Главным госпиталем Северного Флота. С первых дней войны госпиталь был переполнен ранеными, т.к. наступление германских войск было остановлено в нескольких километрах от Мурманска.
22 августа 1941 года в здание госпиталя попали авиабомбы, и он был переведен в другое помещение. В мае 1942 года в связи с проведением наступательной операции госпиталь был расширен до 1000 коек. Значительная часть раненых поступала из частей 14-ой армии и десантных подразделений Северного Флота. Ввиду перегрузки госпиталя сроки пребывания раненых были сокращены за счет усиления эвакуации в тыл страны.
В июне 1942 года авиация противника произвела два массированных налета на Мурманск, в результате чего госпиталь из Мурманска перебазировался в поселок Тюва-губа, где располагался в деревянных приспособленных помещениях.
За период с июня 1942 года по январь 1943 года госпиталь на короткое время дважды возвращался в Мурманск, но из-за постоянных воздушных налетов вынужден был перебазироваться снова, и окончательно возвратился в Мурманск лишь в мае 1944 года, где занимал здание школы. В ходе Печенгско-Киркенесской операции в госпиталь было эвакуировано большое количество раненых из частей 14-ой армии, где им оказывалась квалифицированная и специализированная помощь.
Благодаря упорному труду личного состава госпиталя в годы Великой Отечественной войны было возвращено в строй 14 630 человек. Получили квалифицированную хирургическую помощь 27 265 человек, из них:
С повреждениями черепа 857
Грудной клетки 1 902
Живота 443
Верхних и нижних конечностей 8 010
Было произведено 3 059 сложных оперативных вмешательств.
Раненым было перелито 327,8 литров крови.
С момента начала Великой Отечественной войны коечная емкость госпиталя была увеличена. Кроме хирургического отделения (начальник отделения подполковник м/с Полус Б.С.), где оказывалась многопрофильная медицинская помощь, было организовано травматологическое отделение (начальник отделения подполковник м/с Наставин Б.В.). Весь период войны хирурги госпиталя работали с большой напряженностью. Одномоментно поступало от 200 до 500 раненых, доставляемых морским транспортом.
Хирургической помощью в годы Великой Отечественной войны на Карельском фронте руководил генерал-полковник м/с профессор Вишневский А.А., впоследствии Главный хирург Советской Армии и Военно-Морского Флота. На северном Флоте генерал-лейтенант м/с Арапов Д.А. (член Академии медицинских наук).
В зависимости от района боевых действий на северном Флоте в помощь госпиталям и лазаретам на побережье Кольского полуострова из Мурманского госпиталя выделялись хирургические группы усиления для оказания медицинской помощи. Ввиду частой перегрузки госпиталя раненые эвакуировались в тыл страны, т.к. его дислокацияна основных путях Заполярья вынуждала выполнять функции перевалочной базы.
В период Великой Отечественной войны терапевтическую службу возглавлял профессор Василевская А.К.
Преимущественной патологией на Севере были заболевания органов дыхания и кровообращения, авитаминозы и нарушения питания, заболевания кожи и подкожной клетчатки.
В составе действующей армии 74 военно-морской госпиталь находился с 22 июля 1941 года по 15 ноября 1944 года, обеспечивая части и подразделения 14 армии и Северного флота.
За годы Великой Отечественной войны из числа сотрудников госпиталя награждено:
Орденами 35 человек
Медалью «За оборону Советского Заполярья» 144 человек.
Медалью «За Победу над Германией» 14 человек.
Нагрудным знаком «Отличник санитарной службы» 15 человек.
При госпитале действовали курсы усовершенствования медицинского состава и база стажировки врачей и среднего медицинского персонала.
Госпиталь в годы Великой Отечественной войны своими силами подготовил 133 специалиста, из них:
Хирургов 40
Терапевтов 35
Венерологов 2
Рентгенологов 3
Рентген-техников 5
Лаборантов 20
Физиотерапевтических медсестер 9
Операционного персонала 21
На основании директивы НШ СВ ОШ/4/244107 от 06.05.1957 г. и ДГШ ВМФ ОМУ/13/30151 «С», а так же Директивы Командующего войсками Северного военного округа № ОМО/14/711 от 29.05.1957 г. и приказа Командующего Северным Флотом № 0289 от 13.06.1957 г. 1088 военный госпиталь Северного военного округа и 1815 военно-морской госпиталь СФ объединены с 74 военно-морским госпиталем, по штату № 85/709 на 550 коек. Госпиталь располагался в 3-х гарнизонах. 01.09.1960 года в соответствие с Директивой ГШ СФ № 0111/4/268375 74 ВМГ передан из состава Северного военного округа. С 06.04.1960 г. в соответсвие с Директивой ГК СВ № 0111/1/289615 от 29.03.1960 года 74 военный госпиталь передан из состава Северного военного округа в состав Ленинградского военного округа.
С 01.05.1998 года 74 ВГ переведен на штат 27/024 – 57 согласно Директиве ГШ ВС РФ № 314/6/2414 от 21.11.1997 года со штатом 440 коек, став одним из крупнейших военно-лечебных учреждений на Кольском полуострове. Госпиталь оказывает медицинскую помощь в составе Территориальной системе медицинского обеспечения от Печенгского до Кандалакшского районов Мурманской области.
В 2009 года 74 военный госпиталь был расформирован, а С 01 декабря 2009 года на его базе сформирован на основании Директивы генерального штаба ВС РФ от 10 августа 2009 года № 314/6/3015 и приказа командира в/ч 20226 от 17 ноября 2009 года № 1032, действует на основании лицензии ФС-51-01-000932, выданной Федеральной службой по надзору в сфере здравоохранения и социального развития 16 октября 2012 года и Положения о госпитале Федерального Государственного Учреждения "1469 Военно-морской клинический госпиталь" Минобороны России г. Мурманск.
С 01 декабря 2009 года госпиталь содержался по штату 27/047-51-01 и утвержденному штатному расписанию. Согласно штата было развернуто 150 коек, 7 коечных отделений. В период с 01 декабря 2009 года по май 2010 года госпиталь ФГУ "1469 ВМКГ СФ" г. Мурманск проходил процесс формирования, укомплектование личным составом и оформление лицензий на медицинскую и фармацевтическую деятельности. Лечебно-диагностическую деятельность осуществляет с 01 июня 2010 года.
Госпиталь ФГУ «1469 ВМКГ СФ» г. Мурманск являлся гарнизонным госпиталем Мурманской зоны ТСМО.
На основании директивы штаба СФ от 10.08.2010 г. № 34/1/1694 из штата 27/147 исключен в полном составе Отдел медицинского снабжения (11 штатных единиц) и включено Отделение медицинского снабжения (6 штатных единиц).
На основании указаний генерального штаба ВС РФ от 14 октября 2011 года № 314/6/4338, № 314/6/4587 и от 22 октября 2011 года № 314/6/4485 из штата 27/147 исключены в полном состава с 31 декабря 2011 года Хозяйственное отделение и Столовая.
На основании указаний генерального штаба ВС РФ от 21 марта 2012 года № 314/6/1302 из штата 27/147 исключено в полном составе Травматологическое отделение и увеличен коечный фонд хирургического и инфекционного отделений на 10 коек с добавлением новых должностей.
С 25 апреля 2012 в связи с переходом в содержании только по штату, исключением его по содержания по штатному расписанию переименован в госпиталь Федерального Государственного Казенное Учреждение «1469 Военно-морской клинический госпиталь» г. Минобороны России г. Мурманск.
С 01 сентября 2013 года на основании директив МО РФ от 27.05.13 №№Д-23, Д-24, приказов МО РФ №396,397,398 им указаний начальника Генерального штаба ВС РФ от 26.06.2013 г. в связи с организационно-штатными мероприятиями будет переименован в филиал №3 Федерального Государственного Казенного Учреждения «1469 Военно-морской клинический госпиталь» г. Мурманск (филиал №3 ФГКУ «1469 ВМКГ» Минобороны России г. Мурманск.